《劍與魔法與學園 3》以 RPG 遊戲的經典傳統－劍與魔法的中古歐洲風格為世界觀，人物設定偏向可愛的輕鬆氛圍，玩家不僅可以享受 RPG 的冒險，還有在學園裡學習成長的學園要素。
《劍與魔法與學園 3》主要的目的就是享受中世紀幻想風格的學園生活和 RPG 的冒險。在學園生活的部分，和系列作不同的是一開始玩家要從三所學校中選一所開始故事：多拉肯（?????）學園為正統的幻想風格學園、布莉希亞納（?????）學園是一所有著新潮思想的學園、高千穗（????）義塾則是充滿和風的學園。三所學園不只制服、故事劇情不同，連可以選擇的學科（職業）也不太一樣。
本作創造角色時可以選擇的模組大幅增加，包括種族、制服、性別、樣貌、聲音等等全數超過 7 萬 5000 種以上組合。在加上從本作開始除了主修學科以外還可以選擇副修學科，可以創造出更有原創性的角色。
另外還有特別的一個設定不得不提，在本作就算選擇女性的外表，性別還是可以設定為男性。對於想轉職成男性職業，但外表無論如何還是想要使用女性外表的玩家，或許是項不錯的設計？
本作新增契合度（相性）系統，不管在校內或是迷宮裡，可以在任意時機叫出選單，設定隊伍裡面成員的人際關係。還有滿足特定條件的話可以發動「協力技」。但是，並非全員都可以設定為「友好」，有友好當然就會有討厭，要考慮到培育和關卡攻略的重點來設定契合度。當然也可以單純依自己喜好，想像團體裡的人際關係來設定也是一種樂趣。
在圖書館的公布欄可以選擇任務，接著就是冒險戰鬥的部分了。在本作戰鬥畫面的特效和動畫都有強化，比起前作要來的有臨場感許多。在戰鬥時，加入了新的要素，在特定的時機按下按鈕可以給予敵人大傷害，或是減輕敵人攻擊我方的傷害。
就像前述所說，選擇不同的學校入學，選擇的任務和探險地圖也大不相同，連會出現的敵人也會跟者改變，想要玩遍所有要素，可能至少要玩過三輪才夠也說不定。隨著遊戲進度進行，也會碰到其他學校的學生，要如何進展故事，和哪間學校的學生混熟，玩家的自由度可以說很高。
